Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA4Q00056 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms