Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A1P68400 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms