Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTA1P68133 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms