Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB1P62873 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB1P62873 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB1P62873 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB1P62873 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB1P62873 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB1P62873 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB1P62873 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB1P62873 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB1P62873 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB1P62873 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB1P62873 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB1P62873 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GNB1P62873 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNB1P62873 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNB1P62873 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GNB1P62873 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNB1P62873 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNB1P62873 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNB1P62873 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNB1P62873 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNB1P62873 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNB1P62873 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GNB1P62873 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GNB1P62873 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNB1P62873 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNB1P62873 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNB1P62873 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNB1P62873 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNB1P62873 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GNB1P62873 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GNB1P62873 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GNB1P62873 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB1P62873 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB1P62873 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB1P62873 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB1P62873 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB1P62873 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB1P62873 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB1P62873 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB1P62873 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB1P62873 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB1P62873 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB1P62873 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB1P62873 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB1P62873 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB1P62873 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB1P62873 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB1P62873 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB1P62873 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB1P62873 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB1P62873 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB1P62873 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB1P62873 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB1P62873 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB1P62873 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB1P62873 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB1P62873 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB1P62873 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB1P62873 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB1P62873 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GNB1P62873 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNB1P62873 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNB1P62873 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNB1P62873 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNB1P62873 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNB1P62873 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNB1P62873 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNB1P62873 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNB1P62873 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNB1P62873 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNB1P62873 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNB1P62873 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNB1P62873 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNB1P62873 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNB1P62873 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNB1P62873 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNB1P62873 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNB1P62873 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNB1P62873 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNB1P62873 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNB1P62873 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNB1P62873 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNB1P62873 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNB1P62873 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNB1P62873 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNB1P62873 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GNB1P62873 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNB1P62873 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GNB1P62873 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GNB1P62873 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNB1P62873 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNB1P62873 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GNB1P62873 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNB1P62873 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNB1P62873 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNB1P62873 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNB1P62873 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GNB1P62873 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNB1P62873 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms