Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UFM1P61960 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UFM1P61960 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UFM1P61960 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UFM1P61960 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UFM1P61960 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UFM1P61960 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UFM1P61960 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UFM1P61960 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UFM1P61960 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UFM1P61960 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UFM1P61960 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UFM1P61960 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
UFM1P61960 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UFM1P61960 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UFM1P61960 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UFM1P61960 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UFM1P61960 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UFM1P61960 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UFM1P61960 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UFM1P61960 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UFM1P61960 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UFM1P61960 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UFM1P61960 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UFM1P61960 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UFM1P61960 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UFM1P61960 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UFM1P61960 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UFM1P61960 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UFM1P61960 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UFM1P61960 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UFM1P61960 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UFM1P61960 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UFM1P61960 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
UFM1P61960 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UFM1P61960 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UFM1P61960 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UFM1P61960 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UFM1P61960 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UFM1P61960 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
UFM1P61960 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UFM1P61960 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
UFM1P61960 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFM1P61960 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFM1P61960 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFM1P61960 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFM1P61960 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFM1P61960 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFM1P61960 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFM1P61960 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFM1P61960 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFM1P61960 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFM1P61960 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFM1P61960 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFM1P61960 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFM1P61960 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFM1P61960 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFM1P61960 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFM1P61960 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFM1P61960 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFM1P61960 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFM1P61960 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFM1P61960 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFM1P61960 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFM1P61960 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UFM1P61960 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UFM1P61960 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UFM1P61960 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UFM1P61960 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UFM1P61960 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UFM1P61960 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UFM1P61960 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UFM1P61960 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UFM1P61960 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UFM1P61960 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFM1P61960 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFM1P61960 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UFM1P61960 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFM1P61960 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFM1P61960 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFM1P61960 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFM1P61960 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFM1P61960 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFM1P61960 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFM1P61960 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFM1P61960 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFM1P61960 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFM1P61960 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFM1P61960 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFM1P61960 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFM1P61960 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFM1P61960 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFM1P61960 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFM1P61960 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFM1P61960 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFM1P61960 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFM1P61960 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFM1P61960 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UFM1P61960 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UFM1P61960 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms