Protein–RNA interactions for Protein: P60891

PRPS1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS1P60891 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms