Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SIK1P57059 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SIK1P57059 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIK1P57059 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIK1P57059 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIK1P57059 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIK1P57059 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIK1P57059 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIK1P57059 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIK1P57059 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIK1P57059 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIK1P57059 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIK1P57059 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIK1P57059 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIK1P57059 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIK1P57059 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIK1P57059 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIK1P57059 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SIK1P57059 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIK1P57059 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIK1P57059 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIK1P57059 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIK1P57059 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIK1P57059 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIK1P57059 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIK1P57059 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIK1P57059 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIK1P57059 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIK1P57059 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIK1P57059 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SIK1P57059 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIK1P57059 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIK1P57059 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIK1P57059 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SIK1P57059 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIK1P57059 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIK1P57059 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIK1P57059 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIK1P57059 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIK1P57059 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIK1P57059 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIK1P57059 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIK1P57059 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
SIK1P57059 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SIK1P57059 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIK1P57059 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIK1P57059 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIK1P57059 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIK1P57059 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIK1P57059 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIK1P57059 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIK1P57059 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIK1P57059 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIK1P57059 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIK1P57059 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIK1P57059 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIK1P57059 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIK1P57059 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIK1P57059 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIK1P57059 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIK1P57059 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIK1P57059 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIK1P57059 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SIK1P57059 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIK1P57059 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SIK1P57059 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIK1P57059 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SIK1P57059 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIK1P57059 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIK1P57059 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIK1P57059 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIK1P57059 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIK1P57059 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIK1P57059 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIK1P57059 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIK1P57059 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIK1P57059 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIK1P57059 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIK1P57059 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIK1P57059 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SIK1P57059 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIK1P57059 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIK1P57059 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIK1P57059 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIK1P57059 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIK1P57059 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIK1P57059 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIK1P57059 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SIK1P57059 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIK1P57059 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIK1P57059 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIK1P57059 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIK1P57059 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIK1P57059 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIK1P57059 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIK1P57059 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SIK1P57059 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SIK1P57059 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIK1P57059 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIK1P57059 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms