Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SUMO3P55854 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SUMO3P55854 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SUMO3P55854 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SUMO3P55854 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms