Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SH3BGRP55822 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SH3BGRP55822 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SH3BGRP55822 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SH3BGRP55822 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SH3BGRP55822 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SH3BGRP55822 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SH3BGRP55822 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SH3BGRP55822 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SH3BGRP55822 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SH3BGRP55822 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SH3BGRP55822 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SH3BGRP55822 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SH3BGRP55822 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BGRP55822 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BGRP55822 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BGRP55822 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BGRP55822 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BGRP55822 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BGRP55822 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BGRP55822 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BGRP55822 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BGRP55822 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BGRP55822 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BGRP55822 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BGRP55822 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BGRP55822 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BGRP55822 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BGRP55822 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BGRP55822 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BGRP55822 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SH3BGRP55822 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SH3BGRP55822 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SH3BGRP55822 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SH3BGRP55822 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SH3BGRP55822 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SH3BGRP55822 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SH3BGRP55822 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SH3BGRP55822 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SH3BGRP55822 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SH3BGRP55822 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SH3BGRP55822 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SH3BGRP55822 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SH3BGRP55822 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SH3BGRP55822 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SH3BGRP55822 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SH3BGRP55822 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BGRP55822 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms