Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHBP55084 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHBP55084 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHBP55084 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHBP55084 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHBP55084 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHBP55084 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHBP55084 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHBP55084 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHBP55084 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHBP55084 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHBP55084 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHBP55084 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHBP55084 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHBP55084 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHBP55084 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHBP55084 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHBP55084 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HADHBP55084 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HADHBP55084 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HADHBP55084 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HADHBP55084 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HADHBP55084 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HADHBP55084 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HADHBP55084 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HADHBP55084 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HADHBP55084 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HADHBP55084 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HADHBP55084 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HADHBP55084 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HADHBP55084 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HADHBP55084 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HADHBP55084 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HADHBP55084 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HADHBP55084 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HADHBP55084 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HADHBP55084 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HADHBP55084 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HADHBP55084 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HADHBP55084 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HADHBP55084 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HADHBP55084 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HADHBP55084 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HADHBP55084 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HADHBP55084 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HADHBP55084 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HADHBP55084 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HADHBP55084 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HADHBP55084 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HADHBP55084 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HADHBP55084 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HADHBP55084 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HADHBP55084 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HADHBP55084 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HADHBP55084 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HADHBP55084 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HADHBP55084 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HADHBP55084 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HADHBP55084 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HADHBP55084 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HADHBP55084 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HADHBP55084 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HADHBP55084 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HADHBP55084 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HADHBP55084 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HADHBP55084 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HADHBP55084 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HADHBP55084 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HADHBP55084 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HADHBP55084 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HADHBP55084 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HADHBP55084 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HADHBP55084 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HADHBP55084 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HADHBP55084 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HADHBP55084 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HADHBP55084 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HADHBP55084 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HADHBP55084 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HADHBP55084 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HADHBP55084 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HADHBP55084 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HADHBP55084 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HADHBP55084 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HADHBP55084 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HADHBP55084 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HADHBP55084 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HADHBP55084 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HADHBP55084 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HADHBP55084 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HADHBP55084 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HADHBP55084 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HADHBP55084 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HADHBP55084 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HADHBP55084 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HADHBP55084 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HADHBP55084 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HADHBP55084 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HADHBP55084 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HADHBP55084 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms