Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLTPP55058 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLTPP55058 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLTPP55058 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLTPP55058 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLTPP55058 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLTPP55058 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLTPP55058 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLTPP55058 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLTPP55058 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLTPP55058 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLTPP55058 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLTPP55058 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLTPP55058 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLTPP55058 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLTPP55058 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLTPP55058 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLTPP55058 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLTPP55058 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLTPP55058 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLTPP55058 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLTPP55058 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLTPP55058 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLTPP55058 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLTPP55058 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLTPP55058 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLTPP55058 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLTPP55058 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLTPP55058 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLTPP55058 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLTPP55058 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLTPP55058 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLTPP55058 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLTPP55058 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLTPP55058 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLTPP55058 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLTPP55058 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PLTPP55058 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLTPP55058 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLTPP55058 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLTPP55058 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLTPP55058 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLTPP55058 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLTPP55058 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLTPP55058 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLTPP55058 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLTPP55058 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLTPP55058 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLTPP55058 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLTPP55058 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLTPP55058 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLTPP55058 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLTPP55058 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLTPP55058 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLTPP55058 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLTPP55058 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLTPP55058 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLTPP55058 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLTPP55058 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLTPP55058 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLTPP55058 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLTPP55058 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLTPP55058 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PLTPP55058 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLTPP55058 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLTPP55058 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLTPP55058 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLTPP55058 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLTPP55058 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLTPP55058 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLTPP55058 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLTPP55058 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLTPP55058 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PLTPP55058 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLTPP55058 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLTPP55058 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLTPP55058 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PLTPP55058 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLTPP55058 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLTPP55058 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLTPP55058 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLTPP55058 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLTPP55058 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLTPP55058 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLTPP55058 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLTPP55058 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLTPP55058 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLTPP55058 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLTPP55058 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLTPP55058 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLTPP55058 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PLTPP55058 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLTPP55058 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLTPP55058 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PLTPP55058 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLTPP55058 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PLTPP55058 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLTPP55058 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLTPP55058 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLTPP55058 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms