Protein–RNA interactions for Protein: P55056

APOC4, Apolipoprotein C-IV, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4P55056 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC4P55056 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC4P55056 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC4P55056 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC4P55056 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC4P55056 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC4P55056 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC4P55056 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC4P55056 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC4P55056 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC4P55056 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC4P55056 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC4P55056 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC4P55056 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC4P55056 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC4P55056 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC4P55056 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC4P55056 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC4P55056 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOC4P55056 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOC4P55056 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOC4P55056 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC4P55056 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC4P55056 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC4P55056 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC4P55056 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC4P55056 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC4P55056 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC4P55056 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC4P55056 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC4P55056 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC4P55056 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC4P55056 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC4P55056 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC4P55056 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC4P55056 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC4P55056 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC4P55056 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC4P55056 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC4P55056 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC4P55056 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC4P55056 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC4P55056 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC4P55056 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC4P55056 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC4P55056 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC4P55056 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC4P55056 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC4P55056 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC4P55056 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC4P55056 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC4P55056 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC4P55056 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC4P55056 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC4P55056 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC4P55056 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC4P55056 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC4P55056 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC4P55056 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC4P55056 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC4P55056 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC4P55056 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC4P55056 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC4P55056 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC4P55056 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC4P55056 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC4P55056 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC4P55056 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC4P55056 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC4P55056 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC4P55056 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC4P55056 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC4P55056 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC4P55056 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC4P55056 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC4P55056 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC4P55056 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC4P55056 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC4P55056 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC4P55056 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC4P55056 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC4P55056 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC4P55056 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC4P55056 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC4P55056 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC4P55056 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC4P55056 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC4P55056 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC4P55056 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC4P55056 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC4P55056 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC4P55056 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC4P55056 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC4P55056 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC4P55056 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC4P55056 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC4P55056 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC4P55056 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC4P55056 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC4P55056 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms