Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SLC12A2P55011 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SLC12A2P55011 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC12A2P55011 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC12A2P55011 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC12A2P55011 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC12A2P55011 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC12A2P55011 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC12A2P55011 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC12A2P55011 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC12A2P55011 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC12A2P55011 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC12A2P55011 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC12A2P55011 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC12A2P55011 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC12A2P55011 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC12A2P55011 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC12A2P55011 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC12A2P55011 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC12A2P55011 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC12A2P55011 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC12A2P55011 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC12A2P55011 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC12A2P55011 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC12A2P55011 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC12A2P55011 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC12A2P55011 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC12A2P55011 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC12A2P55011 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC12A2P55011 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC12A2P55011 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SLC12A2P55011 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SLC12A2P55011 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC12A2P55011 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC12A2P55011 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC12A2P55011 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC12A2P55011 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC12A2P55011 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC12A2P55011 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC12A2P55011 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC12A2P55011 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC12A2P55011 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms