Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms