Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms