Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACLYP53396 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACLYP53396 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACLYP53396 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACLYP53396 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACLYP53396 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACLYP53396 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACLYP53396 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACLYP53396 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACLYP53396 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACLYP53396 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACLYP53396 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACLYP53396 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACLYP53396 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACLYP53396 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACLYP53396 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACLYP53396 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACLYP53396 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACLYP53396 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACLYP53396 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACLYP53396 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACLYP53396 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACLYP53396 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACLYP53396 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACLYP53396 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACLYP53396 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACLYP53396 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACLYP53396 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACLYP53396 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ACLYP53396 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACLYP53396 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACLYP53396 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACLYP53396 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACLYP53396 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ACLYP53396 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACLYP53396 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACLYP53396 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACLYP53396 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACLYP53396 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACLYP53396 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACLYP53396 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ACLYP53396 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACLYP53396 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACLYP53396 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACLYP53396 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ACLYP53396 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACLYP53396 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACLYP53396 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACLYP53396 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACLYP53396 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACLYP53396 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACLYP53396 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACLYP53396 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACLYP53396 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACLYP53396 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACLYP53396 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACLYP53396 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACLYP53396 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACLYP53396 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACLYP53396 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACLYP53396 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACLYP53396 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACLYP53396 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACLYP53396 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACLYP53396 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACLYP53396 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACLYP53396 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACLYP53396 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACLYP53396 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACLYP53396 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACLYP53396 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACLYP53396 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACLYP53396 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ACLYP53396 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACLYP53396 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACLYP53396 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACLYP53396 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACLYP53396 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACLYP53396 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACLYP53396 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACLYP53396 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACLYP53396 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACLYP53396 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACLYP53396 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACLYP53396 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACLYP53396 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACLYP53396 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ACLYP53396 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ACLYP53396 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ACLYP53396 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACLYP53396 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACLYP53396 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACLYP53396 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACLYP53396 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACLYP53396 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACLYP53396 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACLYP53396 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACLYP53396 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ACLYP53396 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACLYP53396 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms