Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2A1P52655 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms