Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP5P51878 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP5P51878 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP5P51878 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP5P51878 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP5P51878 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP5P51878 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP5P51878 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP5P51878 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP5P51878 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP5P51878 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP5P51878 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP5P51878 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP5P51878 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP5P51878 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP5P51878 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP5P51878 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP5P51878 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP5P51878 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP5P51878 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP5P51878 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP5P51878 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP5P51878 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP5P51878 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP5P51878 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP5P51878 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP5P51878 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP5P51878 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP5P51878 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP5P51878 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP5P51878 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP5P51878 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP5P51878 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP5P51878 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP5P51878 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP5P51878 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP5P51878 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP5P51878 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP5P51878 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP5P51878 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP5P51878 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP5P51878 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP5P51878 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP5P51878 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP5P51878 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP5P51878 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP5P51878 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP5P51878 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP5P51878 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP5P51878 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP5P51878 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP5P51878 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP5P51878 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP5P51878 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP5P51878 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP5P51878 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP5P51878 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP5P51878 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP5P51878 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP5P51878 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP5P51878 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP5P51878 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP5P51878 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP5P51878 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP5P51878 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP5P51878 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP5P51878 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP5P51878 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP5P51878 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP5P51878 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP5P51878 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP5P51878 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP5P51878 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP5P51878 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP5P51878 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP5P51878 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP5P51878 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP5P51878 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP5P51878 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP5P51878 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP5P51878 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP5P51878 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP5P51878 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP5P51878 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP5P51878 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP5P51878 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP5P51878 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP5P51878 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP5P51878 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP5P51878 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP5P51878 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP5P51878 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP5P51878 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP5P51878 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP5P51878 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP5P51878 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP5P51878 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP5P51878 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP5P51878 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP5P51878 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms