Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DAP3P51398 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DAP3P51398 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DAP3P51398 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DAP3P51398 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DAP3P51398 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DAP3P51398 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DAP3P51398 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DAP3P51398 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DAP3P51398 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DAP3P51398 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DAP3P51398 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DAP3P51398 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DAP3P51398 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DAP3P51398 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DAP3P51398 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DAP3P51398 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DAP3P51398 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DAP3P51398 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DAP3P51398 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DAP3P51398 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DAP3P51398 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DAP3P51398 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
DAP3P51398 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
DAP3P51398 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
DAP3P51398 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DAP3P51398 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
DAP3P51398 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DAP3P51398 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DAP3P51398 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DAP3P51398 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DAP3P51398 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DAP3P51398 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
DAP3P51398 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
DAP3P51398 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
DAP3P51398 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DAP3P51398 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DAP3P51398 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DAP3P51398 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DAP3P51398 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DAP3P51398 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DAP3P51398 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DAP3P51398 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DAP3P51398 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DAP3P51398 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DAP3P51398 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DAP3P51398 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DAP3P51398 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
DAP3P51398 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DAP3P51398 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DAP3P51398 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DAP3P51398 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
DAP3P51398 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DAP3P51398 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DAP3P51398 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DAP3P51398 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DAP3P51398 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DAP3P51398 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DAP3P51398 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DAP3P51398 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DAP3P51398 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DAP3P51398 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DAP3P51398 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DAP3P51398 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DAP3P51398 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DAP3P51398 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
DAP3P51398 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DAP3P51398 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DAP3P51398 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DAP3P51398 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DAP3P51398 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DAP3P51398 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DAP3P51398 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DAP3P51398 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DAP3P51398 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DAP3P51398 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DAP3P51398 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DAP3P51398 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DAP3P51398 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DAP3P51398 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DAP3P51398 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DAP3P51398 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DAP3P51398 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DAP3P51398 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DAP3P51398 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DAP3P51398 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DAP3P51398 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DAP3P51398 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DAP3P51398 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DAP3P51398 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DAP3P51398 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DAP3P51398 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DAP3P51398 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DAP3P51398 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DAP3P51398 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DAP3P51398 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DAP3P51398 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DAP3P51398 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DAP3P51398 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DAP3P51398 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms