Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDE6CP51160 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms