Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPT1P50897 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPT1P50897 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPT1P50897 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPT1P50897 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPT1P50897 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPT1P50897 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPT1P50897 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPT1P50897 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPT1P50897 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPT1P50897 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPT1P50897 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPT1P50897 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPT1P50897 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPT1P50897 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPT1P50897 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPT1P50897 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPT1P50897 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPT1P50897 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPT1P50897 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPT1P50897 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPT1P50897 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPT1P50897 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPT1P50897 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPT1P50897 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPT1P50897 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPT1P50897 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPT1P50897 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPT1P50897 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPT1P50897 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPT1P50897 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPT1P50897 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPT1P50897 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPT1P50897 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPT1P50897 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPT1P50897 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPT1P50897 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPT1P50897 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPT1P50897 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPT1P50897 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPT1P50897 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPT1P50897 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPT1P50897 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPT1P50897 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPT1P50897 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPT1P50897 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPT1P50897 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPT1P50897 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PPT1P50897 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPT1P50897 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPT1P50897 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPT1P50897 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPT1P50897 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PPT1P50897 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPT1P50897 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPT1P50897 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPT1P50897 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPT1P50897 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPT1P50897 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPT1P50897 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PPT1P50897 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPT1P50897 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPT1P50897 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPT1P50897 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPT1P50897 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPT1P50897 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPT1P50897 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPT1P50897 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPT1P50897 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPT1P50897 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPT1P50897 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPT1P50897 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPT1P50897 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPT1P50897 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPT1P50897 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPT1P50897 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPT1P50897 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPT1P50897 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPT1P50897 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPT1P50897 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPT1P50897 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPT1P50897 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPT1P50897 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPT1P50897 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPT1P50897 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPT1P50897 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPT1P50897 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPT1P50897 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PPT1P50897 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PPT1P50897 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PPT1P50897 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PPT1P50897 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PPT1P50897 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PPT1P50897 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PPT1P50897 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PPT1P50897 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PPT1P50897 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PPT1P50897 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PPT1P50897 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PPT1P50897 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms