Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPC1P48995 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms