Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PIP4K2AP48426 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PIP4K2AP48426 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms