Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA8P48165 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA8P48165 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA8P48165 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA8P48165 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA8P48165 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA8P48165 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA8P48165 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA8P48165 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA8P48165 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA8P48165 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA8P48165 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA8P48165 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA8P48165 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA8P48165 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA8P48165 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA8P48165 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA8P48165 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA8P48165 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA8P48165 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA8P48165 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA8P48165 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA8P48165 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA8P48165 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA8P48165 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA8P48165 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA8P48165 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA8P48165 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA8P48165 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA8P48165 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA8P48165 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA8P48165 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA8P48165 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA8P48165 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA8P48165 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA8P48165 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA8P48165 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA8P48165 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA8P48165 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA8P48165 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA8P48165 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA8P48165 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA8P48165 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA8P48165 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA8P48165 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA8P48165 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA8P48165 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA8P48165 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA8P48165 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA8P48165 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA8P48165 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA8P48165 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA8P48165 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA8P48165 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA8P48165 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA8P48165 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA8P48165 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA8P48165 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA8P48165 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA8P48165 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA8P48165 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA8P48165 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA8P48165 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA8P48165 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA8P48165 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA8P48165 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA8P48165 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA8P48165 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA8P48165 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA8P48165 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA8P48165 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA8P48165 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA8P48165 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA8P48165 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA8P48165 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA8P48165 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA8P48165 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA8P48165 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA8P48165 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA8P48165 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA8P48165 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA8P48165 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA8P48165 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA8P48165 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA8P48165 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA8P48165 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA8P48165 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA8P48165 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA8P48165 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA8P48165 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GJA8P48165 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GJA8P48165 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA8P48165 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA8P48165 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA8P48165 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA8P48165 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA8P48165 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA8P48165 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA8P48165 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA8P48165 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms