Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ME1P48163 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ME1P48163 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ME1P48163 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ME1P48163 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ME1P48163 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ME1P48163 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ME1P48163 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ME1P48163 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ME1P48163 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ME1P48163 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ME1P48163 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ME1P48163 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ME1P48163 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ME1P48163 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ME1P48163 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ME1P48163 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ME1P48163 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ME1P48163 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ME1P48163 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ME1P48163 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ME1P48163 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ME1P48163 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ME1P48163 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ME1P48163 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ME1P48163 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ME1P48163 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ME1P48163 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ME1P48163 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ME1P48163 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ME1P48163 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ME1P48163 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ME1P48163 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ME1P48163 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ME1P48163 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ME1P48163 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ME1P48163 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ME1P48163 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ME1P48163 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ME1P48163 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ME1P48163 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ME1P48163 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ME1P48163 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ME1P48163 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ME1P48163 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ME1P48163 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ME1P48163 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ME1P48163 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ME1P48163 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ME1P48163 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ME1P48163 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ME1P48163 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ME1P48163 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ME1P48163 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ME1P48163 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ME1P48163 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ME1P48163 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ME1P48163 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ME1P48163 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ME1P48163 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ME1P48163 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ME1P48163 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ME1P48163 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ME1P48163 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ME1P48163 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ME1P48163 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ME1P48163 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ME1P48163 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ME1P48163 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ME1P48163 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ME1P48163 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ME1P48163 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ME1P48163 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ME1P48163 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME1P48163 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME1P48163 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME1P48163 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME1P48163 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME1P48163 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME1P48163 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME1P48163 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME1P48163 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME1P48163 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME1P48163 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME1P48163 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME1P48163 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME1P48163 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME1P48163 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME1P48163 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME1P48163 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME1P48163 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME1P48163 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME1P48163 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME1P48163 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME1P48163 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME1P48163 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME1P48163 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME1P48163 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME1P48163 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME1P48163 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms