Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRB2P47870 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms