Protein–RNA interactions for Protein: P43686

PSMC4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC4P43686 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMC4P43686 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSMC4P43686 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms