Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms