Protein–RNA interactions for Protein: P38873

KOG1, Target of rapamycin complex 1 subunit KOG1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
KOG1P38873 SIL1YOL031C 1266 nt2.95□□□□□ -1.94
KOG1P38873 SOL3YHR163W 750 nt2.94□□□□□ -1.94
KOG1P38873 MMM1YLL006W 1281 nt2.94□□□□□ -1.94
KOG1P38873 YBL012CYBL012C 402 nt2.94□□□□□ -1.94
KOG1P38873 YPT53YNL093W 663 nt2.94□□□□□ -1.94
KOG1P38873 TVP15YDR100W 432 nt2.93□□□□□ -1.94
KOG1P38873 MOT1YPL082C 5604 nt2.93□□□□□ -1.94
KOG1P38873 ECM5YMR176W 4236 nt2.92□□□□□ -1.94
KOG1P38873 TIF35YDR429C 825 nt2.92□□□□□ -1.94
KOG1P38873 TPD3YAL016W 1908 nt2.92□□□□□ -1.94
KOG1P38873 YER068C-AYER068C-A 432 nt2.91□□□□□ -1.94
KOG1P38873 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.91□□□□□ -1.94
KOG1P38873 MAK21YDR060W 3078 nt2.91□□□□□ -1.94
KOG1P38873 VPS15YBR097W 4365 nt2.91□□□□□ -1.94
KOG1P38873 SLD7YOR060C 774 nt2.91□□□□□ -1.94
KOG1P38873 ARF3YOR094W 552 nt2.91□□□□□ -1.94
KOG1P38873 STD1YOR047C 1335 nt2.91□□□□□ -1.94
KOG1P38873 SSF1YHR066W 1362 nt2.91□□□□□ -1.94
KOG1P38873 OST1YJL002C 1431 nt2.9□□□□□ -1.94
KOG1P38873 VPS54YDR027C 2670 nt2.9□□□□□ -1.94
KOG1P38873 YKT6YKL196C 603 nt2.9□□□□□ -1.95
KOG1P38873 SQS1YNL224C 2304 nt2.89□□□□□ -1.95
KOG1P38873 NOP14YDL148C 2433 nt2.89□□□□□ -1.95
KOG1P38873 NVJ1YHR195W 966 nt2.89□□□□□ -1.95
KOG1P38873 PET309YLR067C 2898 nt2.89□□□□□ -1.95
KOG1P38873 UTP21YLR409C 2820 nt2.89□□□□□ -1.95
KOG1P38873 CUS1YMR240C 1311 nt2.88□□□□□ -1.95
KOG1P38873 RPS28BYLR264W 204 nt2.88□□□□□ -1.95
KOG1P38873 MDM10YAL010C 1482 nt2.88□□□□□ -1.95
KOG1P38873 GRR1YJR090C 3456 nt2.88□□□□□ -1.95
KOG1P38873 YFH1YDL120W 525 nt2.87□□□□□ -1.95
KOG1P38873 YOS1YER074W-A 258 nt2.87□□□□□ -1.95
KOG1P38873 ACT1YFL039C 1128 nt2.87□□□□□ -1.95
KOG1P38873 YLR326WYLR326W 723 nt2.87□□□□□ -1.95
KOG1P38873 MRE11YMR224C 2079 nt2.87□□□□□ -1.95
KOG1P38873 PHO12YHR215W 1404 nt2.87□□□□□ -1.95
KOG1P38873 PHO11YAR071W 1404 nt2.87□□□□□ -1.95
KOG1P38873 OPT2YPR194C 2634 nt2.87□□□□□ -1.95
KOG1P38873 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.87□□□□□ -1.95
KOG1P38873 OSW5YMR148W 447 nt2.87□□□□□ -1.95
KOG1P38873 YOR029WYOR029W 336 nt2.87□□□□□ -1.95
KOG1P38873 SNX41YDR425W 1878 nt2.86□□□□□ -1.95
KOG1P38873 YPR089WYPR089W 2667 nt2.85□□□□□ -1.95
KOG1P38873 YBT1YLL048C 4986 nt2.85□□□□□ -1.95
KOG1P38873 KAP95YLR347C 2586 nt2.85□□□□□ -1.95
KOG1P38873 YGL188CYGL188C 174 nt2.85□□□□□ -1.95
KOG1P38873 RFT1YBL020W 1725 nt2.85□□□□□ -1.95
KOG1P38873 YHR177WYHR177W 1362 nt2.84□□□□□ -1.95
KOG1P38873 STB2YMR053C 2553 nt2.84□□□□□ -1.95
KOG1P38873 RRP7YCL031C 894 nt2.84□□□□□ -1.95
KOG1P38873 RPL27BYDR471W 411 nt2.83□□□□□ -1.96
KOG1P38873 PDX1YGR193C 1233 nt2.83□□□□□ -1.96
KOG1P38873 YBL073WYBL073W 312 nt2.83□□□□□ -1.96
KOG1P38873 GIS1YDR096W 2685 nt2.83□□□□□ -1.96
KOG1P38873 PHO81YGR233C 3537 nt2.83□□□□□ -1.96
KOG1P38873 YKR023WYKR023W 1593 nt2.83□□□□□ -1.96
KOG1P38873 APM3YBR288C 1452 nt2.83□□□□□ -1.96
KOG1P38873 HMO1YDR174W 741 nt2.83□□□□□ -1.96
KOG1P38873 YML003WYML003W 873 nt2.83□□□□□ -1.96
KOG1P38873 NFI1YOR156C 2181 nt2.82□□□□□ -1.96
KOG1P38873 UBP3YER151C 2739 nt2.82□□□□□ -1.96
KOG1P38873 YJR061WYJR061W 2808 nt2.82□□□□□ -1.96
KOG1P38873 RAD50YNL250W 3939 nt2.82□□□□□ -1.96
KOG1P38873 LST7YGR057C 729 nt2.82□□□□□ -1.96
KOG1P38873 TAF2YCR042C 4224 nt2.81□□□□□ -1.96
KOG1P38873 YDL023CYDL023C 321 nt2.81□□□□□ -1.96
KOG1P38873 RPS16BYDL083C 432 nt2.81□□□□□ -1.96
KOG1P38873 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt2.81□□□□□ -1.96
KOG1P38873 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt2.81□□□□□ -1.96
KOG1P38873 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt2.81□□□□□ -1.96
KOG1P38873 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt2.81□□□□□ -1.96
KOG1P38873 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt2.81□□□□□ -1.96
KOG1P38873 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt2.81□□□□□ -1.96
KOG1P38873 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt2.81□□□□□ -1.96
KOG1P38873 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt2.81□□□□□ -1.96
KOG1P38873 MUD1YBR119W 897 nt2.81□□□□□ -1.96
KOG1P38873 UTP20YBL004W 7482 nt2.81□□□□□ -1.96
KOG1P38873 VPS16YPL045W 2397 nt2.81□□□□□ -1.96
KOG1P38873 UBR2YLR024C 5619 nt2.8□□□□□ -1.96
KOG1P38873 PRP6YBR055C 2700 nt2.8□□□□□ -1.96
KOG1P38873 RNR4YGR180C 1038 nt2.79□□□□□ -1.96
KOG1P38873 PEX21YGR239C 867 nt2.79□□□□□ -1.96
KOG1P38873 INA22YIR024C 651 nt2.79□□□□□ -1.96
KOG1P38873 PZF1YPR186C 1290 nt2.79□□□□□ -1.96
KOG1P38873 MEC1YBR136W 7107 nt2.79□□□□□ -1.96
KOG1P38873 SEG1YMR086W 2883 nt2.79□□□□□ -1.96
KOG1P38873 YDL162CYDL162C 357 nt2.78□□□□□ -1.96
KOG1P38873 EAF7YNL136W 1278 nt2.78□□□□□ -1.96
KOG1P38873 TRM732YMR259C 4263 nt2.78□□□□□ -1.96
KOG1P38873 PPE1YHR075C 1203 nt2.78□□□□□ -1.96
KOG1P38873 YLR365WYLR365W 333 nt2.78□□□□□ -1.96
KOG1P38873 BNI1YNL271C 5862 nt2.78□□□□□ -1.97
KOG1P38873 PBI1YPL272C 1554 nt2.77□□□□□ -1.97
KOG1P38873 YIR040CYIR040C 333 nt2.77□□□□□ -1.97
KOG1P38873 snR17asnR17a 333 nt2.77□□□□□ -1.97
KOG1P38873 ATG29YPL166W 642 nt2.77□□□□□ -1.97
KOG1P38873 VHR2YER064C 1518 nt2.77□□□□□ -1.97
KOG1P38873 GLN4YOR168W 2430 nt2.77□□□□□ -1.97
KOG1P38873 RGA2YDR379W 3030 nt2.76□□□□□ -1.97
KOG1P38873 NDT80YHR124W 1884 nt2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20 ms