Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL4P36578 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL4P36578 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL4P36578 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL4P36578 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL4P36578 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL4P36578 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL4P36578 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL4P36578 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL4P36578 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL4P36578 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL4P36578 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL4P36578 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL4P36578 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL4P36578 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL4P36578 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL4P36578 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL4P36578 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL4P36578 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL4P36578 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL4P36578 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL4P36578 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL4P36578 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL4P36578 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL4P36578 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL4P36578 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL4P36578 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL4P36578 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL4P36578 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL4P36578 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL4P36578 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL4P36578 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL4P36578 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL4P36578 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL4P36578 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL4P36578 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL4P36578 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL4P36578 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL4P36578 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL4P36578 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL4P36578 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL4P36578 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL4P36578 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL4P36578 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL4P36578 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL4P36578 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL4P36578 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL4P36578 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL4P36578 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL4P36578 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL4P36578 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL4P36578 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL4P36578 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPL4P36578 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPL4P36578 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPL4P36578 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPL4P36578 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPL4P36578 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPL4P36578 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPL4P36578 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPL4P36578 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPL4P36578 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPL4P36578 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL4P36578 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL4P36578 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL4P36578 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL4P36578 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL4P36578 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL4P36578 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL4P36578 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL4P36578 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL4P36578 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL4P36578 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL4P36578 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL4P36578 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL4P36578 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL4P36578 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL4P36578 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL4P36578 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL4P36578 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL4P36578 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL4P36578 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL4P36578 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL4P36578 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL4P36578 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL4P36578 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL4P36578 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL4P36578 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL4P36578 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL4P36578 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL4P36578 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL4P36578 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL4P36578 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL4P36578 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL4P36578 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL4P36578 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL4P36578 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL4P36578 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL4P36578 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL4P36578 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms