Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP6V1E1P36543 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms