Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHI3L1P36222 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms