Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC1P35052 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC1P35052 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC1P35052 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC1P35052 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC1P35052 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC1P35052 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC1P35052 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC1P35052 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC1P35052 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC1P35052 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC1P35052 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC1P35052 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPC1P35052 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPC1P35052 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPC1P35052 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPC1P35052 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPC1P35052 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPC1P35052 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPC1P35052 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPC1P35052 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPC1P35052 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPC1P35052 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPC1P35052 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPC1P35052 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPC1P35052 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPC1P35052 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPC1P35052 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPC1P35052 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPC1P35052 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPC1P35052 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPC1P35052 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPC1P35052 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPC1P35052 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GPC1P35052 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPC1P35052 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPC1P35052 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPC1P35052 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPC1P35052 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPC1P35052 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPC1P35052 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPC1P35052 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPC1P35052 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPC1P35052 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPC1P35052 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPC1P35052 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GPC1P35052 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPC1P35052 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPC1P35052 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPC1P35052 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPC1P35052 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPC1P35052 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPC1P35052 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPC1P35052 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPC1P35052 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPC1P35052 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPC1P35052 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPC1P35052 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPC1P35052 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPC1P35052 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPC1P35052 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPC1P35052 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPC1P35052 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPC1P35052 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPC1P35052 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPC1P35052 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPC1P35052 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPC1P35052 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPC1P35052 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPC1P35052 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPC1P35052 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPC1P35052 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPC1P35052 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPC1P35052 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GPC1P35052 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPC1P35052 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPC1P35052 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPC1P35052 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPC1P35052 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPC1P35052 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPC1P35052 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPC1P35052 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPC1P35052 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPC1P35052 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPC1P35052 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPC1P35052 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPC1P35052 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPC1P35052 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPC1P35052 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPC1P35052 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPC1P35052 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPC1P35052 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPC1P35052 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPC1P35052 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPC1P35052 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPC1P35052 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPC1P35052 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPC1P35052 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPC1P35052 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPC1P35052 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms