Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTF2H1P32780 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms