Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ECHS1P30084 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ECHS1P30084 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ECHS1P30084 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ECHS1P30084 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ECHS1P30084 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ECHS1P30084 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ECHS1P30084 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ECHS1P30084 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECHS1P30084 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECHS1P30084 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECHS1P30084 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECHS1P30084 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECHS1P30084 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECHS1P30084 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECHS1P30084 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECHS1P30084 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ECHS1P30084 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECHS1P30084 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECHS1P30084 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ECHS1P30084 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECHS1P30084 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECHS1P30084 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECHS1P30084 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECHS1P30084 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECHS1P30084 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECHS1P30084 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECHS1P30084 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECHS1P30084 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECHS1P30084 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECHS1P30084 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECHS1P30084 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECHS1P30084 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECHS1P30084 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECHS1P30084 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECHS1P30084 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECHS1P30084 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECHS1P30084 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECHS1P30084 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECHS1P30084 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECHS1P30084 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms