Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGA1P29973 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGA1P29973 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms