Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCAP28676 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GCAP28676 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GCAP28676 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GCAP28676 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GCAP28676 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCAP28676 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCAP28676 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCAP28676 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCAP28676 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCAP28676 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GCAP28676 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GCAP28676 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCAP28676 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCAP28676 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCAP28676 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCAP28676 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCAP28676 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCAP28676 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCAP28676 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCAP28676 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCAP28676 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCAP28676 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCAP28676 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCAP28676 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCAP28676 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCAP28676 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCAP28676 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCAP28676 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GCAP28676 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCAP28676 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GCAP28676 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCAP28676 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCAP28676 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCAP28676 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCAP28676 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCAP28676 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCAP28676 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCAP28676 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCAP28676 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCAP28676 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GCAP28676 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCAP28676 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCAP28676 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCAP28676 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCAP28676 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCAP28676 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCAP28676 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCAP28676 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCAP28676 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCAP28676 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCAP28676 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCAP28676 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCAP28676 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCAP28676 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCAP28676 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCAP28676 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GCAP28676 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCAP28676 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCAP28676 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCAP28676 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCAP28676 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCAP28676 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCAP28676 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCAP28676 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCAP28676 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCAP28676 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCAP28676 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GCAP28676 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCAP28676 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCAP28676 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCAP28676 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCAP28676 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCAP28676 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCAP28676 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCAP28676 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCAP28676 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCAP28676 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCAP28676 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCAP28676 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCAP28676 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCAP28676 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCAP28676 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GCAP28676 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GCAP28676 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCAP28676 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCAP28676 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCAP28676 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCAP28676 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCAP28676 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCAP28676 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCAP28676 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCAP28676 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCAP28676 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCAP28676 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCAP28676 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCAP28676 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCAP28676 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCAP28676 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GCAP28676 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms