Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PEX2P28328 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PEX2P28328 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PEX2P28328 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PEX2P28328 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PEX2P28328 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PEX2P28328 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PEX2P28328 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PEX2P28328 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PEX2P28328 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PEX2P28328 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PEX2P28328 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PEX2P28328 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PEX2P28328 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PEX2P28328 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PEX2P28328 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
PEX2P28328 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PEX2P28328 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PEX2P28328 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PEX2P28328 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PEX2P28328 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PEX2P28328 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PEX2P28328 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PEX2P28328 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PEX2P28328 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PEX2P28328 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PEX2P28328 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PEX2P28328 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PEX2P28328 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PEX2P28328 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PEX2P28328 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PEX2P28328 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PEX2P28328 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PEX2P28328 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PEX2P28328 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PEX2P28328 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PEX2P28328 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PEX2P28328 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PEX2P28328 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PEX2P28328 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PEX2P28328 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PEX2P28328 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PEX2P28328 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PEX2P28328 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PEX2P28328 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PEX2P28328 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PEX2P28328 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PEX2P28328 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PEX2P28328 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PEX2P28328 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PEX2P28328 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PEX2P28328 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PEX2P28328 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PEX2P28328 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PEX2P28328 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PEX2P28328 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PEX2P28328 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PEX2P28328 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PEX2P28328 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PEX2P28328 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PEX2P28328 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PEX2P28328 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PEX2P28328 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PEX2P28328 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PEX2P28328 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PEX2P28328 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PEX2P28328 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PEX2P28328 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PEX2P28328 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PEX2P28328 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PEX2P28328 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PEX2P28328 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PEX2P28328 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PEX2P28328 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PEX2P28328 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX2P28328 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX2P28328 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX2P28328 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX2P28328 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX2P28328 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX2P28328 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX2P28328 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX2P28328 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX2P28328 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX2P28328 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX2P28328 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX2P28328 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX2P28328 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX2P28328 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX2P28328 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX2P28328 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX2P28328 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX2P28328 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX2P28328 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PEX2P28328 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PEX2P28328 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PEX2P28328 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PEX2P28328 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PEX2P28328 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PEX2P28328 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms