Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 CUTA-213ENST00000494751 731 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.851e-11■■■■■ 27.5
RPS3P23396 CUTA-214ENST00000607266 661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.911e-11■■■■■ 27.5
RPS3P23396 CUTA-207ENST00000479249 562 ntTSL 36.81□□□□□ -1.322e-11■■■■■ 27.5
RPS3P23396 G3BP2-206ENST00000503660 1071 ntTSL 515.32■□□□□ 0.041e-8■■■■■ 27.4
RPS3P23396 G3BP2-211ENST00000507947 665 ntTSL 23.18□□□□□ -1.91e-8■■■■■ 27.4
RPS3P23396 G3BP2-215ENST00000510902 338 ntTSL 30.86□□□□□ -2.271e-8■■■■■ 27.4
RPS3P23396 P4HA2-218ENST00000474628 743 ntTSL 27.58□□□□□ -1.23e-7■■■■■ 27.4
RPS3P23396 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.074e-14■■■■■ 27.4
RPS3P23396 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.375e-10■■■■■ 27.4
RPS3P23396 SPP1-206ENST00000508002 568 ntTSL 1 (best)1.11□□□□□ -2.232e-15■■■■■ 27.4
RPS3P23396 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.122e-8■■■■■ 27.4
RPS3P23396 AC016876.2-201ENST00000581621 4554 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.651e-8■■■■■ 27.4
RPS3P23396 CLPTM1-212ENST00000591304 528 ntTSL 422.6■■□□□ 1.214e-8■■■■■ 27.4
RPS3P23396 CLPTM1-209ENST00000588855 1522 ntTSL 1 (best)18.64■□□□□ 0.584e-8■■■■■ 27.4
RPS3P23396 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 27.3
RPS3P23396 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 27.3
RPS3P23396 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 27.3
RPS3P23396 SCP2-203ENST00000371514 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 27.3
RPS3P23396 SCP2-210ENST00000478631 5204 ntTSL 211.56□□□□□ -0.562e-6■■■■■ 27.3
RPS3P23396 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.352e-6■■■■■ 27.3
RPS3P23396 SCP2-207ENST00000435345 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.42e-6■■■■■ 27.3
RPS3P23396 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.692e-6■■■■■ 27.3
RPS3P23396 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.712e-6■■■■■ 27.3
RPS3P23396 SCP2-211ENST00000484100 671 ntTSL 23.76□□□□□ -1.812e-6■■■■■ 27.3
RPS3P23396 SCP2-216ENST00000533119 742 ntTSL 53.76□□□□□ -1.812e-6■■■■■ 27.3
RPS3P23396 TPP1-211ENST00000528917 559 ntTSL 49.29□□□□□ -0.929e-11■■■■■ 27.3
RPS3P23396 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.322e-7■■■■■ 27.3
RPS3P23396 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.322e-7■■■■■ 27.3
RPS3P23396 LMAN2L-209ENST00000480869 569 ntTSL 414.57□□□□□ -0.081e-8■■■■■ 27.3
RPS3P23396 LMAN2L-208ENST00000474494 322 ntTSL 39.16□□□□□ -0.941e-8■■■■■ 27.3
RPS3P23396 GANAB-206ENST00000526392 257 ntTSL 316.28■□□□□ 0.26e-9■■■■■ 27.3
RPS3P23396 GANAB-205ENST00000526210 533 ntTSL 415.76■□□□□ 0.116e-9■■■■■ 27.3
RPS3P23396 GANAB-209ENST00000529737 577 ntTSL 412.72□□□□□ -0.376e-9■■■■■ 27.3
RPS3P23396 ESYT1-204ENST00000548142 563 ntTSL 311.27□□□□□ -0.618e-7■■■■■ 27.3
RPS3P23396 IMPDH2-201ENST00000326739 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 27.3
RPS3P23396 TM4SF1-203ENST00000493298 702 ntTSL 48.92□□□□□ -0.985e-19■■■■■ 27.3
RPS3P23396 EBP-206ENST00000498425 796 ntTSL 314.29□□□□□ -0.122e-7■■■■■ 27.3
RPS3P23396 CTSD-202ENST00000367196 907 ntTSL 514.26□□□□□ -0.138e-23■■■■■ 27.3
RPS3P23396 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.338e-11■■■■■ 27.3
RPS3P23396 ECH1-202ENST00000594164 677 ntTSL 312.18□□□□□ -0.462e-7■■■■■ 27.3
RPS3P23396 EIF4A1-206ENST00000577929 696 ntTSL 217.89■□□□□ 0.452e-12■■■■■ 27.2
RPS3P23396 EIF4A1-219ENST00000581770 447 ntTSL 213.11□□□□□ -0.312e-12■■■■■ 27.2
RPS3P23396 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 27.2
RPS3P23396 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 27.2
RPS3P23396 RPN1-208ENST00000497415 547 ntTSL 418.17■□□□□ 0.51e-42■■■■■ 27.2
RPS3P23396 RPN1-204ENST00000481168 751 ntTSL 211.83□□□□□ -0.521e-42■■■■■ 27.2
RPS3P23396 CD63-211ENST00000551173 788 ntTSL 317.68■□□□□ 0.427e-8■■■■■ 27.2
RPS3P23396 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.489e-7■■■■■ 27.2
RPS3P23396 NDUFAB1-202ENST00000484769 843 ntTSL 313.28□□□□□ -0.289e-7■■■■■ 27.2
RPS3P23396 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.43e-6■■■■■ 27.2
RPS3P23396 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.723e-6■■■■■ 27.2
RPS3P23396 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.353e-13■■■■■ 27.2
RPS3P23396 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.923e-13■■■■■ 27.2
RPS3P23396 UBE2I-215ENST00000567074 884 ntTSL 1 (best)18.46■□□□□ 0.553e-13■■■■■ 27.2
RPS3P23396 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.53e-13■■■■■ 27.2
RPS3P23396 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.463e-13■■■■■ 27.2
RPS3P23396 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.443e-6■■■■■ 27.2
RPS3P23396 UBE2I-218ENST00000568288 501 ntTSL 517.25■□□□□ 0.353e-13■■■■■ 27.2
RPS3P23396 UBE2I-217ENST00000568209 266 ntTSL 517.1■□□□□ 0.333e-13■■■■■ 27.2
RPS3P23396 ACOT7-205ENST00000377860 1472 ntTSL 1 (best)16.1■□□□□ 0.173e-6■■■■■ 27.2
RPS3P23396 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.153e-6■■■■■ 27.2
RPS3P23396 ACOT7-206ENST00000418124 1564 ntTSL 1 (best)15.87■□□□□ 0.133e-6■■■■■ 27.2
RPS3P23396 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 03e-6■■■■■ 27.2
RPS3P23396 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.083e-13■■■■■ 27.2
RPS3P23396 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.123e-6■■■■■ 27.2
RPS3P23396 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.133e-13■■■■■ 27.2
RPS3P23396 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.33e-13■■■■■ 27.2
RPS3P23396 UBE2I-219ENST00000568989 498 ntTSL 212.94□□□□□ -0.343e-13■■■■■ 27.2
RPS3P23396 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.383e-13■■■■■ 27.2
RPS3P23396 UBE2I-214ENST00000566775 396 ntTSL 38.07□□□□□ -1.123e-13■■■■■ 27.2
RPS3P23396 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.113e-6■■■■■ 27.2
RPS3P23396 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.293e-6■■■■■ 27.2
RPS3P23396 PRG2-203ENST00000530105 1048 ntTSL 511.88□□□□□ -0.513e-6■■■■■ 27.2
RPS3P23396 PRG2-204ENST00000533605 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.63e-6■■■■■ 27.2
RPS3P23396 RNASEH2A-203ENST00000590279 696 ntTSL 322.03■■□□□ 1.123e-6■■■■■ 27.2
RPS3P23396 RNASEH2A-202ENST00000590121 859 ntTSL 219.99■□□□□ 0.793e-6■■■■■ 27.2
RPS3P23396 RNASEH2A-205ENST00000639767 647 ntTSL 515.09■□□□□ 0.013e-6■■■■■ 27.2
RPS3P23396 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.011e-8■■■■■ 27.1
RPS3P23396 GPR137-211ENST00000539833 998 ntTSL 1 (best)25.95■■□□□ 1.742e-9■■■■■ 27.1
RPS3P23396 GPR137-219ENST00000546201 790 ntTSL 325.95■■□□□ 1.742e-9■■■■■ 27.1
RPS3P23396 GPR137-208ENST00000536667 800 ntTSL 525.95■■□□□ 1.742e-9■■■■■ 27.1
RPS3P23396 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.472e-9■■■■■ 27.1
RPS3P23396 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.872e-9■■■■■ 27.1
RPS3P23396 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.622e-9■■■■■ 27.1
RPS3P23396 GPR137-218ENST00000546139 1274 ntTSL 1 (best)17.19■□□□□ 0.342e-9■■■■■ 27.1
RPS3P23396 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.32e-9■■■■■ 27.1
RPS3P23396 ABCC6-205ENST00000576204 1914 ntTSL 516.88■□□□□ 0.292e-9■■■■■ 27.1
RPS3P23396 TLN1-206ENST00000486788 551 ntTSL 515.79■□□□□ 0.122e-9■■■■■ 27.1
RPS3P23396 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.172e-9■■■■■ 27.1
RPS3P23396 ABCC6-202ENST00000456970 4137 ntTSL 213.43□□□□□ -0.262e-9■■■■■ 27.1
RPS3P23396 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.32e-9■■■■■ 27.1
RPS3P23396 GPR137-210ENST00000538244 350 ntTSL 311.11□□□□□ -0.632e-9■■■■■ 27.1
RPS3P23396 ACVR2B-201ENST00000352511 11821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.732e-9■■■■■ 27.1
RPS3P23396 PSMD2-220ENST00000496925 723 ntTSL 29.7□□□□□ -0.862e-6■■■■■ 27.1
RPS3P23396 LRG1-202ENST00000586883 571 ntTSL 49.37□□□□□ -0.913e-7■■■■■ 27.1
RPS3P23396 PSMD2-203ENST00000432855 609 ntTSL 39.05□□□□□ -0.962e-6■■■■■ 27.1
RPS3P23396 PSMD2-216ENST00000488085 543 ntTSL 48.55□□□□□ -1.042e-6■■■■■ 27.1
RPS3P23396 LGALS3BP-217ENST00000591274 379 ntTSL 514.75□□□□□ -0.053e-25■■■■■ 27.1
RPS3P23396 TPP1-203ENST00000436873 560 ntTSL 415.3■□□□□ 0.041e-7■■■■■ 27.1
RPS3P23396 ATP5B-209ENST00000551570 399 ntTSL 38.21□□□□□ -1.11e-44■■■■■ 27.1
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