Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALB2P22676 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALB2P22676 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALB2P22676 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALB2P22676 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALB2P22676 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALB2P22676 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALB2P22676 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALB2P22676 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALB2P22676 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALB2P22676 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALB2P22676 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALB2P22676 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALB2P22676 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALB2P22676 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALB2P22676 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALB2P22676 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALB2P22676 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALB2P22676 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALB2P22676 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALB2P22676 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALB2P22676 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALB2P22676 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALB2P22676 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALB2P22676 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALB2P22676 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALB2P22676 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALB2P22676 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALB2P22676 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALB2P22676 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALB2P22676 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALB2P22676 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALB2P22676 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CALB2P22676 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALB2P22676 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALB2P22676 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALB2P22676 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALB2P22676 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALB2P22676 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALB2P22676 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALB2P22676 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALB2P22676 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CALB2P22676 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALB2P22676 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALB2P22676 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALB2P22676 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALB2P22676 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALB2P22676 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALB2P22676 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALB2P22676 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALB2P22676 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALB2P22676 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALB2P22676 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALB2P22676 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALB2P22676 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALB2P22676 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALB2P22676 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALB2P22676 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALB2P22676 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALB2P22676 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CALB2P22676 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALB2P22676 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALB2P22676 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALB2P22676 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALB2P22676 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALB2P22676 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALB2P22676 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALB2P22676 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALB2P22676 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALB2P22676 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALB2P22676 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALB2P22676 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALB2P22676 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALB2P22676 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALB2P22676 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALB2P22676 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALB2P22676 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALB2P22676 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CALB2P22676 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALB2P22676 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CALB2P22676 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALB2P22676 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALB2P22676 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALB2P22676 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CALB2P22676 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALB2P22676 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALB2P22676 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALB2P22676 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALB2P22676 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALB2P22676 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALB2P22676 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALB2P22676 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALB2P22676 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALB2P22676 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALB2P22676 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALB2P22676 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CALB2P22676 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALB2P22676 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALB2P22676 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALB2P22676 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms