Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCP20941 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCP20941 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCP20941 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCP20941 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCP20941 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCP20941 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCP20941 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCP20941 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCP20941 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCP20941 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCP20941 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCP20941 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCP20941 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCP20941 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCP20941 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCP20941 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCP20941 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCP20941 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCP20941 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCP20941 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCP20941 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCP20941 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCP20941 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCP20941 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCP20941 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCP20941 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCP20941 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCP20941 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCP20941 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCP20941 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCP20941 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCP20941 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCP20941 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCP20941 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCP20941 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCP20941 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCP20941 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCP20941 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCP20941 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCP20941 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCP20941 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCP20941 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCP20941 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCP20941 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCP20941 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCP20941 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCP20941 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCP20941 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCP20941 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCP20941 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCP20941 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCP20941 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCP20941 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCP20941 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCP20941 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCP20941 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCP20941 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCP20941 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCP20941 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCP20941 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCP20941 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCP20941 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCP20941 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCP20941 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCP20941 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCP20941 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCP20941 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCP20941 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCP20941 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCP20941 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCP20941 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCP20941 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCP20941 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCP20941 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCP20941 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCP20941 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCP20941 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCP20941 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCP20941 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCP20941 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCP20941 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PDCP20941 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDCP20941 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDCP20941 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDCP20941 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCP20941 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCP20941 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCP20941 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCP20941 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCP20941 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCP20941 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCP20941 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCP20941 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCP20941 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCP20941 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCP20941 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCP20941 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCP20941 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCP20941 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms