Protein–RNA interactions for Protein: P19237

TNNI1, Troponin I, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI1P19237 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNNI1P19237 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms