Protein–RNA interactions for Protein: P17787

CHRNB2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB2P17787 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms