Protein–RNA interactions for Protein: P17706

PTPN2, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN2P17706 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN2P17706 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms