Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXB4P17483 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms