Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCL3L1P16619 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms