Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTLA4P16410 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CTLA4P16410 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms