Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms