Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB1P14653 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB1P14653 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB1P14653 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB1P14653 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB1P14653 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB1P14653 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB1P14653 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB1P14653 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB1P14653 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB1P14653 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB1P14653 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB1P14653 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB1P14653 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB1P14653 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB1P14653 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB1P14653 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB1P14653 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXB1P14653 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXB1P14653 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXB1P14653 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXB1P14653 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXB1P14653 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXB1P14653 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXB1P14653 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXB1P14653 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXB1P14653 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms