Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB3P14651 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms